南湖网讯（通讯员 赵甜甜）6月16日上午，新西兰生物信息学家Ms. Cecilia Deng受我校徐娟教授的邀请做客园林楼419，带来了一场以“现代育种中基因组学技术的应用”为主题的学术讲座。
Cecilia Deng首先介绍了目前新西兰植物与食品研究所的研究现状，研究所主要以消费者喜好为指向，进行以猕猴桃、西洋梨等为主的育种，并借以先进的技术手段进行研究。其次她讲解了基因组的组装与注释，对测序的数据通过软件进行组装并调整参数，主要以Hi-C即Chromosome(染色体) Conformation(构象) Capture(捕获)(3C)+NGS 技术进行，再进行重叠群分析和搭建支架，再到染色体水平的组装并预测基因可能的结构与功能，最后进行注释。Cecilia以新西兰特有的麦卢卡蜂蜜讲解了基因组的组装，并以猕猴桃为例进行高通量基因组注释的讲述。她还讲述了运用GBS workflow等软件进行高通量基因型的研究，即以传统的实验操作技术加上先进分析技术完成所需数据。最后以猕猴桃一组数据讲述了目前的研究进展，并表明参考基因组的重要性。
除了精彩的报告，Cecilia还从新西兰带来了美食与大家分享，在轻松的氛围中，同学们全神贯注聆听讲座，并向Cecilia提出自己的问题。果树学朱峰博士问到：“芽变是否会影响基因组数据？” Cecilia回答说她看到芽变的情况很少，目前也没有遇到过这种情况，但理论上讲应该影响不是很大。杨宏宾也问到如果平均两份DNA进行测序用20×结果不一，是否是因为×量太少。Cecilia回答说是的，条件允许的情况下×数高一些会有更准确的结果等。
讲座在同学们的积极提问和讨论中结束，同学们都感觉收获颇多，和Cecilia的交流中解决了一些困扰自己很久的问题。
人物简介：Cecilia Hong Deng，新西兰植物与食品研究所（PFR）高级生物信息学家。主要研究领域包括梨、苹果、猕猴桃、柑橘、真菌及细菌的基因组学和转录组学的生物信息学研究。目前，Cecilia的研究工作包括西洋梨（巴梨）、猕猴桃、苹果基因组测序、组装，蔷薇科苹果亚科SNP-CHIP设计制作等大型项目。
